双方向仲裁委员会请求确认仲裁协议的效力，由仲裁委员会作出决定。当事人对仲裁协议的异议，应当在仲裁庭首次开庭前提出。仲裁协议的效力问题关系到仲裁程序能否进行，如果当事人对仲裁协议的效力有异议，仲裁程序就不能进行。仲裁委员会如果确认仲裁协议有效，则该决定是终局的，当事人不可以再向人民法院提出确认仲裁协议效力之诉讼。

双方向人民法院请求确认仲裁协议的效力，由人民法院适用特别程序，一审终局，作出裁定。如果法院认定仲裁协议有效，就可以继续进行仲裁；如果法院认定仲裁协议没有法律效力，就必须由人民法院进行管辖。

一方请求仲裁委员会对仲裁协议的效力作出决定，另一方请求人民法院对仲裁协议的效力作出裁定，按照审判最终决定原则，应由人民法院受理，并作出仲裁协议是否有效的裁定。